Lincoln Burrows sitzt in der Todeszelle der Fox River State Strafanstalt. Er wurde wegen des Mordes an Terrence Steadman, dem Bruder der Vizepräsidentin, zum Tode verurteilt. Lincoln beteuerte seine Unschuld, allerdings sprachen alle Beweise gegen ihn. Nur sein kleinerer Bruder Michael ist von Anfang an von seiner Unschuld überzeugt und versucht alles um Lincoln zu retten.
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\r\nLincoln hatte vor seiner Inhaftierung immer wieder Probleme und kam schon mehrmals mit dem Gesetz in Konflikt. Sein Sohn LJ lebt bei Lincolns Ex-Frau Lisa und hat sich seit der Inhaftierung von ihm abgewandt, was Lincoln sehr verletzte. Allerdings ist die Beziehung der Beiden nach einem klärenden Gespräch besser wie nie zuvor.
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\r\nVon Michaels Ausbruchsplan war Lincoln anfangs nicht überzeugt. Er sagte zu seinem Bruder, dass er seine Zeit absitzen solle und bei guter Führung früher entlassen wird. Lincoln ist sehr besorgt um seinen Bruder, da der Gefängnisaltag sehr hart ist und er Michael nicht vor den anderen Häftlingen schützen kann. Als Lincoln feststellt, dass Michaels Plan wirklich klappen könnte, ist er damit einverstanden und hilft seinem Bruder wo er kann.