Man kann ohne Umschweife sagen, dass John Abruzzi der mächgtiste Insasse von Fox River ist und jemand, den man auf keinen Fall zum Feind sondern zum Verbündeten haben will. Er war der Boss der Mafia von Chicago und allein dieser Umstand hat ihm seinen Status in Fox River, wo er wegen Mordkomplotts und zweifachen Mordes einsitzt, beschert.

Seine Beziehung zu Michael ist eine reine Zweckgemeinschaft. Michael hat etwas, das Abruzzi will und diesen benötigt wiederum Michael, um seinen Ausbruchs-Plan, auch wirklich umsetzen zu können. Abruzzi, der der Leiter der Gefängnis-Industrie ist, soll Michael in sein Team aufnehmen, damit dieser näher bei Lincoln sein kann und sicherstellen, dass nach dem Ausbruch ein Flugzeug bereit steht, mit dem sie fliehen können. Im Gegenzug nimmt Michael ihn mit nach draußen und verrät ihm den Aufenthaltsort des Kronzeugen Fibonacci, der Abruzzi damals hinter Gittern gebracht hat und in ein paar Wochen erneut aussagen soll, was eine Menge Verbündete von Abruzzi ebenfalls ins Gefängnis bringen würde.